구역제도는 1975년부터 시작되었습니다. 당시는 편의상 4개의 속회를 하나로 묶은 것에 불과했으나 1979년에는 10개의 속회를 하나의 구역으로 묶어 7개 구역으로 편성하였습니다. 이후 계속된 교회의 부흥과 성장으로 1980년 7월 100속 (당시 10개 구역)을 돌파하자 효율적인 속회 관리가 어려워졌고 이에 따라 ‘돌봄의 목회’차원에서 구역제도를 보완하게 되었습니다. 

그리하여 1981년 1월부터 교회의 구역을 12개의 구역으로 조직하고 각 구역에 구역장을 세워 속회를 관리하도록 하는 새로운 체계가 세워졌습니다. 이후 몇 번의 수정 과정을 거쳐 1994년 13개 구역 체제로 정착한 것이 이어져 내려오다가 2006년 교회 창립 80주년을 맞이하여 평안구역이 신설되었고, 2007년에는 인내구역이 둘로 나뉘어 구원구역이 새롭게 신설되었습니다. 2009년에는 새롭게 기쁨구역과 감사구역이 신설되었으나 2013년에 다시 구역 간 규모 편차를 해소하기 위해 감사구역을 해체하였으며, 송도구역과 연수구역을 조정하여 충만구역을 신설하게 되었습니다. 이후, 2015년에는 창립 90주년을 맞이하여 구역명을 성서 지명에서 차용하여 전면 교체함과 동시에 지역 경계를 탈피한 부부(다메섹)구역을 신설하였습니다. 2019년 부부(다메섹)구역은 세대통합을 위해 각 구역 부부속으로 분배하였으며, 현재 9개 구역으로 재편되어 운영하고 있습니다.

2015년부터는 성서의 지명을 차용하여 구역의 이름을 정했습니다. 현재 총 2개 교구, 9개 구역으로 운영하고 있으며 구역구분은 아래와 같습니다.